Clift menikah dengan Suzzanna pada bulan Mei 1983 ketika ia belum genap berumur sembilan belas tahun di gereja Santa Maria Fatima, Magelang.[2] Pernikahan berlangsung sampai Suzzanna meninggal pada tahun 2008.[3]

Clift Sangra terlibat kasus penembakan terhadap F.X. Abriyarso Boyoh, suami dari Kiki Maria, anak Suzzanna dari pernikahannya dengan aktor Dicky Suprapto.[4] Karena kasus tersebut Clift Sangra divonis 4 bulan penjara oleh Pengadilan Negeri Magelang.[5]

Pada 9 Agustus 2009, Clift menikah lagi dengan Nana Mahliana Hasan, seorang SPG keturunan Maghribi dan Banjar. Pernikahan tersebut dilakukan secara siri karena perbedaan agama.[6][7] Pasangan ini sejak itu telah dikaruniai seorang anak pada tahun 2011.[8] Sebelumnya, Clift dan Suzzanna telah mengadopsi anak, Rama Yohanes yang diketahui telah bergabung dengan TNI Angkatan Darat pada tahun 2015.[9]